Institutionen för immunologi, genetik och patologi vid Uppsala universitet har en bred forskningsprofil med starka forskargrupper inriktade på bl. a cancer, genetiska och autoimmuna sjukdomar. En av de bärande tankarna vid institutionen är att stimulera translationell forskning och därmed främja en närmare samverkan mellan medicinsk forskning och sjukvården. Forskning bedrivs inom sex forskningsprogram: cancerprecisionsmedicin, cancerimmunterapi, genomik och neurobiologi, molekylära verktyg och funktionsgenomik, neuroonkologi och neurodegeneration samt vaskulärbiologi. Delar av verksamheten är även integrerad med avdelningarna för onkologi, klinisk genetik, klinisk immunologi, klinisk patologi och sjukhusfysik vid Akademiska sjukhuset. Institutionen har undervisningsuppdrag på ett antal programutbildningar, fristående kurser och internationella masterprogram inom den medicinska fakulteten. Institutionen omsätter omkring 550 miljoner kronor, varav ca två tredjedelar är externa forskningsbidrag. Antalet anställda är ca 400, varav ca 100 är doktorander, och det finns totalt över 850 verksamma i arbetsstyrkan. Läs gärna mer om institutionens verksamhet här: www.uu.se/medarbetare/institution/immunologi-genetik-och-patologi
Arbetsuppgifter
Vi söker en forskningsassistent inom beräkningsbiologi för att arbeta i projekt inriktade på utveckling av beräkningsmetoder (statistiska metoder och maskininlärning) för data från encelliga genuttryck för att härleda komplexa cellegenskaper. Forskargruppen är kopplad till SciLifeLab och ingår i det nationella programmet för datadriven livsvetenskap (DDLS), generöst finansierat av Knut och Alice Wallenbergs stiftelse.
Kvalifikationskrav
Relevanta ämnesområden inkluderar beräkningsbiologi, datavetenskap, molekylärbiologi och angränsande områden. Färdigheter i skärningspunkten mellan statistik, programmering och biologi krävs. Den sökande behöver dokumenterad erfarenhet av att arbeta med encelliga och/eller spatial transkriptomikdata.
Kandidaten måste ha goda kunskaper i R- eller Python-programmering samt erfarenhet av utveckling av originalkod och algoritmer för dataanalys. Erfarenhet av statistik, hantering av stora datamängder (kvantitativa, hundratals funktioner, hundratals objekt), dataanalys och visualisering förväntas. Flytande engelska i tal och skrift är nödvändigt.
Meriterande
Någon av följande färdigheter anses meriterande.
- Erfarenhet av robust och reproducerbar pipeline-utveckling
- Erfarenhet av funktionsinferens (t.ex. inferering av klonalitet)
- Erfarenhet av projektledning
- Erfarenhet av HPC, parallellisering och hantering av stora datamängder
Om anställningen
Anställningen är tidsbegränsad, 6 månader med möjlighet till förlängning. Omfattningen är heltid. Tillträde enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala
Upplysningar om anställningen lämnas av: Marcel Tarbier, [email protected]
Välkommen med din ansökan senast den 12 oktober 2026, UFV-PA 2026/2741
Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla 7 500 anställda och 53 000 studenter som med nyfikenhet och engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser.
Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet
https://uu.se/om-uu/jobba-hos-oss/
Anställningen kan komma att säkerhetsprövas. Vid säkerhetsprövning är en förutsättning för anställning att sökande blir godkänd.
Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.
Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Fackliga företrädare: Saco-S - [email protected], Seko - [email protected], ST (OFR/S) - [email protected]
Öppen för alla Vi fokuserar på din kompetens, inte dina övriga förutsättningar. Vi är öppna för att anpassa rollen eller arbetsplatsen efter dina behov.
